Perú es uno de los centros de diversidad de ajíes nativos y similares (Capsicum spp.). Esta diversidad no ha sido suficientemente explotada, y estas variedades se encuentran en peligro de extinción. Su biocomercialización como productos diferenciados de alto valor podría favorecer su conservación. Este estudio identificó oportunidades de biocomercialización de ajíes nativos, principalmente mediante la implementación de una encuesta con 205 hogares en “Lima Moderna” (clase media y alta en Lima Metropolitana). Los resultados sugieren que: (a) soló se encuentran posicionados comercialmente cuatro variedades de Capsicum; (b) los hogares muestran preferencia por ajíes nativos de color amarillo y rojo, de picor medio-alto, mientras que las características nutricionales y tamaño no son relativamente importantes; (c) nichos de mercado relevantes incluyen a la certificación orgánica y la de comercio justo; y (d) los consumidores, por el momento, no indicaron mayor interés en la denominación de origen para este tipo de producto en particular. Este estudio de caso ilustra como la conservación de la biodiversidad de éstas y otras variedades nativas podría incentivarse mediante el biocomercio en el Perú y en otros países de alta biodiversidad.