Antecedentes: Para desarrollar programas de prevención adaptables al nivel local o aprobar en forma apropiada nuevas vacunas contra el dengue, hay una necesidad urgente por estudios de campo longitudinales y exhaustivos que monitoreen la enfermedad en su población humana así como también la densidad del vector. Metodología y Hallazgos Principales: Reportamos los resultados provenientes de este tipo de estudio con duración de 5 años realizado en la ciudad Amazónica de Iquitos, Perú donde se monitoreó serológicamente la infección con el virus de dengue (DENV) dentro de una cohorte de 2.400 personas en sus vecindarios así como también casos febriles activos en un subgrupo del cohorte mediante vigilancia de ausencias en sus colegios. En las muestras basales, el 80% de la población del estudio tuvo anticuerpos contra el DENV, la seroprevalencia incrementó con la edad, lo cual demostraba una variación geográfica significativa, con tasas de seroprevalencia por zonas ajustadas por la edad entre 67.1 y 89.9%. Durante los primeros 15 meses del estudio cuando DENV-1 y DENV-2 estaban circulando, las tasas de incidencia para toda la población fueron entre 2 a 3 infecciones/100 años-persona. La introducción de DENV-3 en la segunda mitad de 2001 se caracterizó por 3 periodos distintos: amplificación del virus por un mínimo de 5-6 meses, reemplazo del serotipo previamente circulando, y transmisión epidémica cuando la tasa de incidencia llegó a su pico de 89 infecciones/100 años-persona. Conclusiones/Significancia: Los patrones de incidencia fueron distintos geográficamente de las tasas de prevalencia basales antes de la introducción del serotipo DENV-3, pero muy similares durante el periodo de invasión. La transmisión varió geográficamente, con su pico de incidencia ocurridos en tiempos diferentes entre las 8 zonas geográficas; cubriendo ~16 km2 de la ciudad. El tiempo entre la introducción de un nuevo serotipo hasta la transmisión epidémica y el conocimiento de aquellas zonas geográficas con riesgo de transmisión elevada, deben ser consideradas en la aplicación efectiva de los recursos limitados para prevenir el dengue.