Aunque la mortalidad y morbilidad por Enfermedad Diarreica Aguda (EDA) por Rotavirus ha disminuido significativamente en las últimas décadas, la diarrea sigue siendo un problema global de salud pública con un mayor impacto en países en vías de desarrollo, en donde esta enfermedad constituye una de las principales causas de morbimortalidad infantil. El objetivo de este trabajo fue determinar rotavirus en los menores de 5 años en el Área de Salud N° 1 de la Ciudad de Loja, y los principales signos y síntomas de EDA por Rotavirus, para representar estadísticas actualizadas de esta patología en nuestra población lojana. Dentro de la encuesta se investigó variables como: la edad, sexo, el método de diagnóstico clínico y de laboratorio; para la confirmación del etiológico y conocimiento de las personas más propensas a la enfermedad. Para ello se diseñó un estudio descriptivo de cohorte transversal, se empleo como área de investigación el Centro de Salud N° 1 de la Ciudad de Loja durante los meses Julio-Septiembre 2012. Para la investigación se utilizó una población de 60 niños/as menores de cinco años que habían asistido a la consulta con diagnóstico de síndrome diarreico agudo. De estos, se determinó que 29 pacientes menores de 5 años eran positivos mediante el diagnóstico con la prueba de inmunocromatografía en heces fecales, correspondiendo a un porcentaje del 48%. Del total de la población, la 2 edad pediátrica para casos positivos de rotavirus, lo constituyen los niños/as en edades 13 meses a 24 meses. En este estudio el resultado del trabajo de campo determino que las niñas fueron más afectadas que los niños. Los resultados encontrados afirman la presencia del etiológico rotavirus en los niños/as atendidos en el Centro de Salud N°1 confirmando de esta manera su presencia y frecuencia aunque en menor proporción que en años anteriores como lo indican otros trabajos investigativos previos a este sobre el mismo tema.