Objetivo. Comparar el ELISA para coproantígenos y el examen microscópico directo (EMD) en la detección de Giardia lamblia en niños de edad escolar del distrito de Chongoyape. Chiclayo, Perú. Materiales y métodos. Se realizó un estudio transversal entre noviembre del 2014 y enero del 2015 en 133 niños, para el cual se usó un cuestionario estructurado para obtener información sociodemográfica y de saneamiento. La detección de G. lamblia requirió del examen de muestras seriadas de heces, mediante EMD y ELISA. Resultados. Del total de muestras, en 43,6% (58/133) y 30,1% (40/133) se detectó G. lamblia por ELISA y EMD respectivamente. Ambas técnicas tuvieron una concordancia Kappa de 0,715 (p<0,001). Los factores asociados a G. lamblia fueron tener entre 3 a 5 años (OR: 2,42, IC 95%: 1,14 - 5,15), la vivienda con piso de tierra (OR: 3,73, IC 95%: 1,82 - 7,66) y el contacto con animales (OR: 7,0, IC 95%: 1,75 - 27,94). Conclusiones. Nuestros resultados muestran una alta sensibilidad y mayor rendimiento de la prueba de ELISA, pudiendo reemplazar al EMD en estudios epidemiológicos y en el diagnóstico especializado, no obstante, el menor costo y la capacidad de detectar varios parásitos ofrecen una ventaja al EMD en la práctica diaria. Asimismo, se revela una alta prevalencia de giardiasis en la población estudiada, poniendo de manifiesto la vigencia de ésta parasitosis como problema de salud pública en la región.